La Hermandad del Cristo de Burgos pudo surgir de la refundación de algunas antiguas hermandades. Existió una hermandad del Cristo de Burgos en el Convento Casa Grande de San Francisco y también se sabe que tuvo su sede en la iglesia de San Ildefonso. Además, existió antiguamente una hermandad de las Negaciones y Lágrimas de San Pedro de los estudiantes. Sin embargo, no se conoce la fecha de la fundación1 aunque se cree que fue a finales del siglo XVI.
Cuando esta cofradía realizó su primera estación de penitencia en 1889 con un solo paso tenía el título de Hermandad del Santo Cristo de Burgos y Madre de Dios de la Palma. Y más tarde se le añadió el título de Negaciones y Lágrimas de San Pedro cuando se redactaron unas nuevas reglas en 1943.
En 1932 la Hermandad encargó un grupo escultórico que representase el momento evangélico de las Negaciones de San Pedro. Seguramente con la idea de añadir al título de la hermandad el de las Negaciones y Lágrimas de San Pedro, un hecho que se consumó once años más tarde. Este misterio fue encomendado al escultor Lorenzo Coullaut-Valera para que imaginara el tercer paso de esta cofradía. Sin embargo, el proyecto se frustró con el fallecimiento de este gran escultor ese mismo año.
El extraordinario misterio que a día de hoy podía procesionar en la Semana Santa de Sevilla es una realidad en la localidad alicantina de Orihuela. En 1958 el hijo del escultor, Federico Coullaut-Valera, lo reprodujo para la Hermandad del Prendimiento. No obstante, la providencia quiso que este pasaje evangélico no solo estuviera presente en la semana grande de Sevilla, sino también en el Miércoles Santo con la Hermandad del Carmen Doloroso.
